Рассматривается проблема восстановления пространственной структуры биологических молекул и их ассоциаций (например, в вирусах, кристаллах) по электронномикроскопическим снимкам, которые представляют собой двумерные проекции этих трехмерных объектов. Описаны возможности физических методов — оптической дифракции, фильтрации и голографии — в интерпретации электронных микрофотографий. Даны основы математической теории трехмерной реконструкции по проекциям: метода Фурье, алгебраических методов, аналитических методов. Сделан обзор применения методов трехмерной реконструкции к изучению ряда объектов: белковых кристаллов, спиральных структур из глобулярных белков, бактериофагов, сферических вирусов.