Выпуски

 / 

1997

 / 

Февраль

  

Обзоры актуальных проблем


Неупорядоченные полимеры


Институт биохимической физики РАН, ул. Косыгина 4, Москва, 119334, Российская Федерация

Рассматривается одиночная макромолекула с такими формами беспорядка, как разветвления, узлы и гетерогенные последовательности химически различных мономерных звеньев. Во всех случаях рассматриваются математически простейшие подходы, достаточные для достижения физического понимания. Для разветвленных полимеров изложена простая теория типа Флори, демонстрирующая различие классов универсальности для полимеров с замороженными и размороженными ветвлениями. Для узлов рассмотрена другая теория типа Флори, описывающая как набухание и/или коллапс полимерного кольца с замороженной топологией, так и распределение по узлам для размороженного случая. Для рассмотрения гетерополимеров систематически используется так называемая модель случайных энергий (МСЭ) Дерриды, заимствованная из теории спиновых стекол. Она позволяет описать просто и вместе с тем строго как стеклование глобулы гетерополимера со случайной последовательностью, так и конструирование последовательностей с энергетически оптимизированной конформацией основного состояния. Наряду с аналитической теорией рассматриваются компьютерные тесты стеклования пространственной структуры и конструирования последовательностей. Гипотеза о том, что в ходе биологической и/или предбиологической эволюции первичные структуры белков прошли стадию конструирования, ведет к предсказанию определенного типа корреляций в последовательностях белков. Изложенные в работе статистические тесты действительно выявляют корреляции предсказанного типа.

Текст pdf (817 Кб)
English fulltext is available at DOI: 10.1070/PU1997v040n02ABEH000192
PACS: 36.20.−r, 64.70.−p, 87.10.+e, 87.10.-v (все)
DOI: 10.3367/UFNr.0167.199702b.0129
URL: https://ufn.ru/ru/articles/1997/2/b/
A1997WT28000002
Цитата: Гросберг А Ю "Неупорядоченные полимеры" УФН 167 129–166 (1997)
BibTexBibNote ® (generic)BibNote ® (RIS)MedlineRefWorks

English citation: Grosberg A Yu “Disordered polymersPhys. Usp. 40 125–158 (1997); DOI: 10.1070/PU1997v040n02ABEH000192

Список литературы (157) Статьи, ссылающиеся на эту (38) ↓ Похожие статьи (20)

  1. He Q, Zou Sh et al J. Chem. Educ. 102 (10) 4489 (2025)
  2. Finkelstein A V, Bogatyreva N S et al Biophys Rev 14 (6) 1255 (2022)
  3. Soranno A Archives of Biochemistry and Biophysics 685 108305 (2020)
  4. Polotsky A A Polym. Sci. Ser. C 60 (S1) 3 (2018)
  5. Li S, Erdemci-Tandogan G et al J. Phys.: Condens. Matter 30 (4) 044002 (2018)
  6. Caetano D L Z, de Carvalho S J et al Phys. Chem. Chem. Phys. 19 (34) 23397 (2017)
  7. Bruinsma R F, Comas-Garcia M et al Phys. Rev. E 93 (3) (2016)
  8. Wagner Je, Erdemci-Tandogan G, Zandi R J. Phys.: Condens. Matter 27 (49) 495101 (2015)
  9. Grosberg A Y Soft Matter 10 (4) 560 (2014)
  10. Kolupaev B B, Lyashuk T G, Kolupaev B S J Eng Phys Thermophy 87 (2) 474 (2014)
  11. van der Schoot P, Zandi R J Biol Phys 39 (2) 289 (2013)
  12. Zhao Ya, Ferrari F J. Stat. Mech. 2013 (10) P10010 (2013)
  13. Lyashuk T G, Kolupaev B B International Polymer Science and Technology 39 (12) 31 (2012)
  14. Grosberg A Yu Polym. Sci. Ser. C 54 (1) 1 (2012)
  15. Zhao Ya, Ferrari F J. Stat. Mech. 2012 (11) P11022 (2012)
  16. Kozyrev S V Proc. Steklov Inst. Math. 274 (S1) 1 (2011)
  17. Bogacheva E N, Bogachev A N et al BIOPHYSICS 56 (6) 1011 (2011)
  18. Maresov E A, Semenov A N Macromolecules 41 (23) 9439 (2008)
  19. Subbotin A V, Semenov A N Polym. Sci. Ser. A 49 (12) 1328 (2007)
  20. Grosberg A Yu, Khokhlov A R Advances in Polymer Science Vol. Conformation-Dependent Design of Sequences in Copolymers IIAfter-Action of the Ideas of I.M. Lifshitz in Polymer and Biopolymer Physics196 Chapter 55 (2006) p. 189
  21. Semenov A N Phys. Rev. E 73 (4) (2006)
  22. Semenov A N Europhys. Lett. 76 (6) 1116 (2006)
  23. Grechannikov A V Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling 21 (1) (2006)
  24. Olemskoi A, Savelyev A Physics Reports 419 (4-5) 145 (2005)
  25. Shaitan K V Russian Journal of Electrochemistry 39 (2) 198 (2003)
  26. Grosberg A, Frisch H J. Phys. A: Math. Gen. 36 (34) 8955 (2003)
  27. Govorun E N, Khokhlov A R, Semenov A N Eur. Phys. J. E 12 (2) 255 (2003)
  28. Borovinskiy A L, Grosberg A Yu The Journal of Chemical Physics 118 (11) 5201 (2003)
  29. Ferrari F Annalen der Physik 514 (4) 255 (2002)
  30. Krupyanskii Yu F, Gol’danskii V I Uspekhi Fizicheskikh Nauk 172 (11) 1247 (2002)
  31. Olemskoi A I Uspekhi Fizicheskikh Nauk 171 (5) 503 (2001)
  32. Nelson E D, Wolynes P G, Onuchic J N Nonconvex Optimization and Its Applications Vol. Optimization in Computational Chemistry and Molecular BiologyAn approach to detect the dominant folds of proteinlike heteropolymers from the statistics of a homopolymeric chain40 Chapter 7 (2000) p. 107
  33. Denesyuk N A, Erukhimovich I Ya The Journal of Chemical Physics 113 (9) 3894 (2000)
  34. Khokhlov A R, Khalatur P G Physica A: Statistical Mechanics and its Applications 249 (1-4) 253 (1998)
  35. Semenov A N, Likhtman A E Macromolecules 31 (25) 9058 (1998)
  36. Finkelstein A V, Badretdinov A Ya Folding and Design 3 (1) 67 (1998)
  37. Khalatur P G, Ivanov V A et al Russ Chem Bull 47 (5) 855 (1998)
  38. Zhdanov V P, Kasemo B Proteins 29 (4) 508 (1997)

© Успехи физических наук, 1918–2025
Электронная почта: ufn@ufn.ru Телефоны и адреса редакции О журнале Пользовательское соглашение