RSS-ленты
РусскийEnglish
Выпуск 11, 2024
Том год страница
Выпуски Авторы PACS Подписчикам Для авторов

Выпуски

 / 

1997

 / 

Февраль

←  →

Обзоры актуальных проблем


Неупорядоченные полимеры


Институт биохимической физики РАН, ул. Косыгина 4, Москва, 119334, Российская Федерация

Рассматривается одиночная макромолекула с такими формами беспорядка, как разветвления, узлы и гетерогенные последовательности химически различных мономерных звеньев. Во всех случаях рассматриваются математически простейшие подходы, достаточные для достижения физического понимания. Для разветвленных полимеров изложена простая теория типа Флори, демонстрирующая различие классов универсальности для полимеров с замороженными и размороженными ветвлениями. Для узлов рассмотрена другая теория типа Флори, описывающая как набухание и/или коллапс полимерного кольца с замороженной топологией, так и распределение по узлам для размороженного случая. Для рассмотрения гетерополимеров систематически используется так называемая модель случайных энергий (МСЭ) Дерриды, заимствованная из теории спиновых стекол. Она позволяет описать просто и вместе с тем строго как стеклование глобулы гетерополимера со случайной последовательностью, так и конструирование последовательностей с энергетически оптимизированной конформацией основного состояния. Наряду с аналитической теорией рассматриваются компьютерные тесты стеклования пространственной структуры и конструирования последовательностей. Гипотеза о том, что в ходе биологической и/или предбиологической эволюции первичные структуры белков прошли стадию конструирования, ведет к предсказанию определенного типа корреляций в последовательностях белков. Изложенные в работе статистические тесты действительно выявляют корреляции предсказанного типа.

Текст pdf (817 Кб)
English fulltext is available at DOI: 10.1070/PU1997v040n02ABEH000192
PACS: 36.20.−r, 64.70.−p, 87.10.+e, 87.10.-v (все)
DOI: 10.3367/UFNr.0167.199702b.0129
URL: https://ufn.ru/ru/articles/1997/2/b/
A1997WT28000002
Цитата: Гросберг А Ю "Неупорядоченные полимеры" УФН 167 129–166 (1997)
BibTexBibNote ® (generic)BibNote ® (RIS)MedlineRefWorks

English citation: Grosberg A Yu “Disordered polymers” Phys. Usp. 40 125–158 (1997); DOI: 10.1070/PU1997v040n02ABEH000192

Список литературы (157) Статьи, ссылающиеся на эту (36) ↓ Похожие статьи (20)

  1. Finkelstein A V, Bogatyreva N S et al Biophys Rev 14 1255 (2022)
  2. Soranno A Archives of Biochemistry and Biophysics 685 108305 (2020)
  3. Polotsky A A Polym. Sci. Ser. C 60 3 (2018)
  4. Li S, Erdemci-Tandogan G et al J. Phys.: Condens. Matter 30 044002 (2018)
  5. Caetano D L Z, de Carvalho S J et al Phys. Chem. Chem. Phys. 19 23397 (2017)
  6. Bruinsma R F, Comas-Garcia M et al Phys. Rev. E 93 (3) (2016)
  7. Wagner Je, Erdemci-Tandogan G, Zandi R J. Phys.: Condens. Matter 27 495101 (2015)
  8. Grosberg A Y Soft Matter 10 560 (2014)
  9. Kolupaev B B, Lyashuk T G, Kolupaev B S J Eng Phys Thermophy 87 474 (2014)
  10. van der Schoot P, Zandi R J Biol Phys 39 289 (2013)
  11. Zhao Ya, Ferrari F J. Stat. Mech. 2013 P10010 (2013)
  12. Zhao Ya, Ferrari F J. Stat. Mech. 2012 P11022 (2012)
  13. Lyashuk T G, Kolupaev B B International Polymer Science and Technology 39 31 (2012)
  14. Grosberg A Yu Polym. Sci. Ser. C 54 1 (2012)
  15. Kozyrev S V Proc. Steklov Inst. Math. 274 1 (2011)
  16. Bogacheva E N, Bogachev A N et al BIOPHYSICS 56 1011 (2011)
  17. Maresov E A, Semenov A N Macromolecules 41 9439 (2008)
  18. Subbotin A V, Semenov A N Polym. Sci. Ser. A 49 1328 (2007)
  19. Grosberg A Yu, Khokhlov A R Advances in Polymer Science Vol. Conformation-Dependent Design of Sequences in Copolymers IIAfter-Action of the Ideas of I.M. Lifshitz in Polymer and Biopolymer Physics196 Chapter 55 (2006) p. 189
  20. Semenov A N Phys. Rev. E 73 (4) (2006)
  21. Grechannikov A V 21 (1) (2006)
  22. Semenov A N Europhys. Lett. 76 1116 (2006)
  23. Olemskoi A, Savelyev A Physics Reports 419 145 (2005)
  24. Grosberg A, Frisch H J. Phys. A: Math. Gen. 36 8955 (2003)
  25. Govorun E N, Khokhlov A R, Semenov A N Eur. Phys. J. E 12 255 (2003)
  26. Borovinskiy A L, Grosberg A Yu 118 5201 (2003)
  27. Ferrari F Annalen der Physik 514 255 (2002)
  28. Krupyanskii Yu F, Gol’danskii V I Uspekhi Fizicheskikh Nauk 172 1247 (2002)
  29. Olemskoi A I Uspekhi Fizicheskikh Nauk 171 503 (2001)
  30. Nelson E D, Wolynes P G, Onuchic J N Nonconvex Optimization and Its Applications Vol. Optimization in Computational Chemistry and Molecular BiologyAn approach to detect the dominant folds of proteinlike heteropolymers from the statistics of a homopolymeric chain40 Chapter 7 (2000) p. 107
  31. Denesyuk N A, Erukhimovich I Ya 113 3894 (2000)
  32. Khokhlov A R, Khalatur P G Physica A: Statistical Mechanics and its Applications 249 253 (1998)
  33. Semenov A N, Likhtman A E Macromolecules 31 9058 (1998)
  34. Finkelstein A V, Badretdinov A Ya Folding and Design 3 67 (1998)
  35. Khalatur P G, Ivanov V A et al Russ Chem Bull 47 855 (1998)
  36. Zhdanov V P, Kasemo B Proteins 29 508 (1997)
© Успехи физических наук, 1918–2024
Электронная почта: ufn@ufn.ru Телефоны и адреса редакции О журнале Пользовательское соглашение